Miljøministeriet voksede sig stort og magtfuldt, da nu afdøde Svend Auken var elementernes minister i 90'erne.
I løbet af 10 år med borgerligt styre fik Miljøministeriet en lillesøster, da nuværende EU-klimakommissær Connie Hedegaard i 2007 blev den første minister for det nyoprettede Klima- og energiministerium.
