Arne Lyngesen var efter sin juridiske embedseksamen i 1969 ansat i Justitsministeriet, inden han blev dommerfuldmægtig og senere retsassessor ved byretterne i Holbæk, Roskilde og Glostrup. I 1983 fulgte udnævnelsen til landsdommer i Østre Landsret, hvor han senere blev beskikket som ledende retsformand. Arne Lyngesen har interesseret sig for standens løn- og arbejdsvilkår - en interesse, der har medført, at han 1988-1997 var standens repræsentant i Danmarks Jurist- og Økonomforbunds hovedbestyrelse og næstformand i forbundets forening for tjenestemænd. Han blev pensioneret i 2009.