John Münsberg tog i 1992 afsked med forsvaret. Efter overstået officersuddannelse indledte han tjeneste ved 1. Regiment i Høvelte, og karrieren fortsatte på skiftende poster, bl.a. også som lærer og sagsbehandler i militær sammenhæng. Efter udnævnelsen til oberstløjtnant i 1979 blev John Münsberg chef for Panserinfanteribataljon/Danske Livregiment i Vordingborg, og fra 1981 havde han tjeneste ved Hærens Kampskole. Med rang af oberst var han fra 1986 chef for Danske Livregiment og 3. Sjællandske Kampgruppe og tillige garnisonskommandant i Vordingborg til afskeden i 1992.