Lilly Christensen er specialist i alfabetisering, dvs. at lære voksne, der aldrig har gået i skole, at læse og skrive. Det er hun så god til, at hun i mange år har været Danmarks repræsentant i et ekspertudvalg under Nordisk Råd, som arbejder med at forbedre indvandreres sprogundervisning. I sidste måned fremlagde hun sammen med en svensk kollega, Qarin Francker, et oplæg til en helt ny uddannelse af sproglærere på en nordisk konference i Sandefjord i Norge, og det fik en så god modtagelse, at danske uddannelsesinstitutioner om kort tid kan tilbyde en masteruddannelse for alfabetiseringslærere. Lilly Christensen arbejder også med undervisning af ordblinde og er medforfatter til en serie lærebøger i dansk grammatik, rettet specielt mod fremmedsprogede. I en del år var hun medlem af Undervisningsministeriets opgavekommission, som lavede opgaverne til danske sprogskolers prøver, men hun trak sig, da dette arbejde blev flyttet til Integrationsministeriet for at blive brugt til at vurdere, om eleverne kunne opnå dansk statsborgerskab.