Det var ad handelsvejen, at Jens Peter Larsen i sin tid skabte sig en karriere i Udenrigsministeriet. Han blev handelsuddannet i årene 1957-61, og efter en ombæring i hæren, hvor fødselaren endte som premierløjtnant af reserven, kom Jens Peter Larsen i 1965 til virksomheden Olie-Norden som prokurist. 1970-72 havde han samme charge i firmaet Johann Haltermann. Oven på en HD i organisation i 1972 og andre job i det private britiske og amerikanske erhvervsliv kom Jens Peter Larsen i 1975 til Udenrigsministeriets daværende handelsafdeling. Første udepost fik Jens Peter Larsen i rollen som handelsattaché og siden -råd ved den danske ambassade i Moskva. Efter en ombæring hjemme i ministeriet som bl.a. kontorchef fik Jens Peter Larsen i 1989 sin første ambassadørpost - i Singapore, hvorfra han også bestyrede de danske interesser i sultanatet Brunei. Fem år senere rykkede ambassadøren videre i Asien - nu som dansk diplomatisk førstemand i Sydkoreas hovedstad, Seoul. Fra 1999 til 2002 var Jens Peter Larsen ambassadør i Argentina, og herfra dækkede han en lang række andre lande i Sydamerika - den sidste del af perioden med adresse i København. Tilbage i Udenrigsministeriet virkede han bl.a. i Danmarks Eksportråd. I 2008 blev Jens Peter Larsen pensioneret fra Udenrigstjenesten.