Det lå ikke i kortene, at Mogens Rüdiger skulle beskæftige sig med energi og energiforsyningens historiske udvikling. Men en forespørgsel om at skrive historien om Dong A/S' første 25 år sporede ham ind på emnet, der med få afstikkere har fulgt ham siden 1995. Mogens Rüdiger blev kandidat i historie fra Københavns Universitet i 1979 og tog sin ph.d.-grad i 1984 på en afhandling om socialdemokratens Gustav Bangs historiesyn. Siden fulgte blandt andet et pionerarbejde om Danmarks historie 1945 til 1990, der blev skrevet sammen med folketingsbibliotekar Hanne Rasmussen, et portræt af Uffe Ellemann-Jensen og en biografi om Erling Foss. Efter ansættelser på Københavns Universitet og CBS blev Mogens Rüdiger i 1999 lektor på Aalborg Universitet i europæisk samtidshistorie. 2000-2001 var han gæsteforsker på UC Berkeley, Californien, hvor han skrev den hyppigt anvendte bog 'Statens synlige hånd' om forholdet mellem velfærd, stat og individ i det 20. århundrede. Bogen var en del af Magtudredningen. Som medforfatter til 'Handelspolitikken under Den Kolde Krig' (2012, sammen med Per Boje og Marianne Rostgaard) har han undersøgt Danmarks rolle i den strategiske eksportkontrol over for de kommunistiske lande. Det er imidlertid energien, der fylder mest i forskningen. I 2007 blev han dr.phil. på afhandlingen 'Energi og regulering', og senere skrev han 'Energi i forandring' (2011) om dannelsen af Dong.