John E. Jensen afsluttede en læreruddannelse i 1957, mødte grønlandske Karoline, der også var lærer, og parret flyttede samme år til Grønland som ægtepar. I Grønland fik han job som lærer i Maniitsoq, i Ammassalik på østkysten, i Paamiut og Sisimiut, inden han i 1972 kom til Nuuk, hvor han blev udnævnt til skoledirektør. Otte år senere tog han endnu et avancement og blev kultur- og undervisningsdirektør under Grønlands Selvstyre. I 1981 blev han sekretariatschef for Det Offentlige Aftalenævn. Karrieren inden for selvstyret fortsatte, og fra 1985-88 var han styrets direktør. Karoline døde i 1991, og John E. Jensen flyttede til Frederiksberg. Han var i en årrække medlem af bestyrelsen for Arktisk Institut. Først i fjor udtrådte han af bestyrelsen, men følger meget nøje udviklingen i Grønland gennem pressen og ved enkelte besøg i landet.