Som rektor for Christianshavns Gymnasium i perioden 1989-2007 havde Jens Bencke stor betydning for gymnasiets udvikling og ånd. Han var kendt som en karismatisk, lyttende og tolerant rektor med stor viden ikke blot om sine egne fag, samfundsfag og idræt, men om mange fagområder. I forbindelse med Benckes runde fødselsdag siges det, at han »gennem sin ledelse og sin personlighed har været med til at udvikle gymnasiet til en skole, som er præget af høj faglighed, og til en skole, som er kendt for at inddrage elever og ansatte i skolens udvikling.
Jens’ måde at udvikle skolen på var præget af stor tillid og høje forventninger til sine medmennesker, et positivt livssyn, der i høj grad medvirkede til at få det bedste frem i skolens elever og ansatte«. Jens Bencke blev cand.mag. fra Københavns Universitet i 1973. Efterfølgende virkede han som adjunkt og siden studielektor ved Sankt Annæ Gymnasium, før han i 1989 satte sig i rektorstolen på Christianshavn Gymnasium. Her virkede han indtil pensioneringen i 2007 – hvorefter han blev lektor på Ingrid Jespersens Skole. Han har bestridt en lang række faglige tillidshverv i både ind- og udland, ligesom han har skrevet flere lærebøger. I 2006 var Jens Bencke med til at stifte foreningen ’Etiopiens børn’, og han var foreningens formand 2006-2012. Foreningen driver et børnehjem for 70 forældreløse og tidligere gadebørn i det nordlige Etiopien.
