Frem til 1990 arbejdede Ole Emil Malmstrøm i en række rådgivende ingeniørfirmaer, samt i daværende Boligfonden Bikuben med ansvaret for Sparekassen Bikubens bygge- og indretningsaktiviteter, og derpå som souschef i Kuben BYG. Fra 1990 til 2009 var han afdelingsdirektør for drift, vedligehold og Facilities Management i Kuben Ejendomsadministration A/S, hvorefter han etablerede konsulentfirmaet Real-FM, der placerer ham centralt i udviklingen af Facilities Management i Danmark og internationalt. DTU anvender ham ofte som censor i Facilities Management. Han var i 1991 medstifter af Dansk Facilities Management - netværk, DFM, været netværkets formand i 9 år. Internationalt var han medstifter af NordicFM, som formand de første 3 år, deltager aktivt i amerikanske IFMA's aktiviteter, stod i 2012 i spidsen for den europæiske EFMC-konference i København, og har siddet 4 år i bestyrelsen for det europæiske Facilities Management netværk, EuroFM, hvor han i dag er æresmedlem. I fritiden er han formand for også sociale foreninger, samt blandt andet ivrigt engageret i driften af Sporvejsmuseet Skjoldenæsholm, hvor man ofte møder ham som vognstyrer på sporvognene.