Langt den største del af sit arbejdsliv har han beskæftiget sig med fødevarelovgivning og administration. Umiddelbart efter dannelsen af Fødevareministeriet, hvor han blev vicedirektør i Fødevaredirektoratet, nedsatte ministeriet en arbejdsgruppe af erfarne medarbejdere under hans ledelse, som skulle samle og modernisere alle lovregler på fødevareområdet i Danmarks første samlede lov om fødevarer. Den vigtigste nyskabelse i loven blev en statsliggørelse af fødevarekontrollen med henblik på effektivisering og skabelse af en nødvendig ensartethed i lovgivningens administration og kontrol. I dette arbejde havde Jørgen Fredsted en central rolle. I en række år var han dansk repræsentant i EU's stående levnedsmiddelkomite, hvor man behandlede og vedtog en lang række kommissionsdirektiver. Hans fritidsinteresser har primært ligget i sportens verden, hvor han har haft flere tillidsposter. Hans medlemskab af udvalg i DIF udløber til næste år på grund af alder. Han er stadig engageret i fægteidrætten som formand for Fægtekunstens Venner, en lille organisation, som støtter navnlig unge talenter med tilskud til udstyr og rejser. P.t. er han ikke aktiv fægter, men løber stadig på ski i Alperne to gange om året.